男性淋病：潜伏期1～14天（平均3～5天），表现为淋菌性尿道炎，尿道口红肿、尿道有脓性分泌物、尿痛、排尿困难。少数病例感微热和疲乏。累及两侧腹股沟淋巴结时，局部红肿疼痛。但相当多的患者可无症状，仍为传染源。
    尿道炎未治疗，反复发作，粘膜炎症可形成疤痕及尿道狭窄。淋球菌上行蔓延可并发前列腺炎、精囊炎、输精管炎和附睾炎。检查发现前列腺均匀肿大，有压痛；附睾炎时，阴囊肿胀，有触痛；输精管炎症阻塞可致不育，但少见。
    女性淋病：潜伏期约10天，临床症状不如男性特异。根据感染部位，如为尿道，则有尿频、尿痛及排尿烧灼感，可见尿道口红肿，有少量脓性分泌物；如为宫颈，则阴道排出物增加。窥镜可见宫颈红肿、易出血及分泌物，有触痛及性交痛。偶尔腰痛及下腹痛。前庭大腺感染时，腺开口红肿，有分泌物，严重者形成脓肿。但80%女性患者症状轻微或无症状，是潜在的传染源。
    如炎症未及时控制，淋球菌上行感染可并发盆腔炎。临床表现发热、下腹疼痛、双侧附件压痛、子宫颈举痛及粘液脓性分泌物增多。患者输卵管炎症后阻塞可继发不育或宫外孕。幼女阴道上皮发育不完全，受淋球菌侵犯时可发生外阴阴道炎。
    淋菌性结膜炎： 成人多为自体接种或接触分泌物污染的物品而感染，多为单侧。新生儿分娩经产道时受染，2～3天后出现症状，多为双侧眼结膜充血、水肿及脓性分泌物。角膜受感染，可发生溃疡、甚至穿孔，导致失明。
淋菌性咽炎和直肠炎：见于男性同性恋及有口交或肛交性行为的患者。多数患者可无症状，少数有咽痛或肛门烧灼、瘙痒或里急后重感。检查上述部位，可见粘膜充血、肿胀及脓性分泌物。
    播散性淋球菌感染：淋球菌进入血行，可引起败血症、多发性关节炎、心包炎、心内膜炎、脑膜炎以及皮肤损害。