疾病预防控制机构应当按照规定组织开展AEFI的调查、诊断工作。AEFI中，绝大部分为轻微的一般反应，一般不需要组织开展调查。对怀疑为异常反应的病例，疾病预防控制机构应按照规定组织开展调查工作，必要时应组织异常反应调查诊断专家组进行诊断，专家组应当依据法律、行政法规、部门规章和技术规范，结合临床表现、医学检查结果和疫苗质量检验结果等，进行综合分析，作出诊断结论。

　　对怀疑因疫苗质量不合格给受种者造成损害的，按照疫苗质量事故的处理程序，依照本法和《中华人民共和国药品管理法》等有关规定组织开展调查、处理。怀疑因接种单位违反预防接种工作规范、免疫程序、疫苗使用指导原则、接种方案给受种者造成损害的，依照《医疗事故处理条例》等有关规定组织开展调查、处理。